ubuntu配置R语言环境-创新互联
ubuntu进不去root,貌似是每次开机时默认root密码都会产生一个新的。
成都创新互联公司一直通过网站建设和网站营销帮助企业获得更多客户资源。 以"深度挖掘,量身打造,注重实效"的一站式服务,以做网站、网站设计、移动互联产品、全网营销推广服务为核心业务。10多年网站制作的经验,使用新网站建设技术,全新开发出的标准网站,不但价格便宜而且实用、灵活,特别适合中小公司网站制作。网站管理系统简单易用,维护方便,您可以完全操作网站资料,是中小公司快速网站建设的选择。
使用sudo passwrd重置root密码
2. apt-get install r-base
3. apt-get install r-base-dev
4. 安装成功。
5. 安装Rstudio
下载安装包安装
下载 R-3.2.2.tar.gz
解压:
tar
-zvxf
R-2.13.0.tar.gz
配置:
cd
R-2.13.0
./configure
--prefix=/home/xxx/R
--enable-R-shlib
prefix设置R的安装路径,enable-R-shlib可以保证lib目录下的动态库能够共享
如果提示G77错误
sudo
apt-get
install
build-essential
sudo
apt-get
install
gfortran
如果提示错误:configure:error:--with-readline=yes(default)...
sudo
apt-get
install
libreadline6-dev
如果提示错误:configure:error:--with-x=yes(default) and X11...
sudo
apt-get
install
libxt-dev
安装:
make
make
install
link到bin目录下:
cd
/bin
sudo
ln
-sv
/home/xxx/R/bin/R
至此安装完毕。
------------------------------------------------------
安装pkg:
终端下输入:R
source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()
默认将安装一下几个包
affy affydata affyPLM
annaffy annotate Biobase
Biostrings DynDoc gcrma
genefilter geneplotter hgu95av2
limma marray matchprobes
multtest ROC vsn
xtable affyQCReport
如果需要Bioconductor上别的包的话,可以使用
biocLite(c("pkg1", "pkg2"))
如:
biocLite(c("copula",
"pspline"))
安装CRAN上的包
install.packages(c("pkg1",
"pkg2"))
来安装(pkg1和pkg2为需要安装的包)。
------------------------------------------------------
编辑器:
1.直接shell。终端输入R,就进入R命令行了。
2.安装GUI:Rcmdr
sudo
apt-get
install
r-cran-rodbc
sudo
apt-get
install
r-cran-rcmdr
运行R后,library(Rcmdr)就可以打开图形界面。
另外有需要云服务器可以了解下创新互联cdcxhl.cn,海内外云服务器15元起步,三天无理由+7*72小时售后在线,公司持有idc许可证,提供“云服务器、裸金属服务器、高防服务器、香港服务器、美国服务器、虚拟主机、免备案服务器”等云主机租用服务以及企业上云的综合解决方案,具有“安全稳定、简单易用、服务可用性高、性价比高”等特点与优势,专为企业上云打造定制,能够满足用户丰富、多元化的应用场景需求。
本文名称:ubuntu配置R语言环境-创新互联
当前链接:http://scyanting.com/article/gcsoc.html