如何用R语言ggplot2画折线图并添加误差线

本篇文章给大家分享的是有关如何用R语言ggplot2画折线图并添加误差线,小编觉得挺实用的,因此分享给大家学习,希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获,话不多说,跟着小编一起来看看吧。

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折线图添加误差线是非常常用的一种可视化方法,今天的推文介绍一下使用R语言的ggplot2作图的代码。模仿的是论文 Phased diploid genome assemblies and pan-genomes provide insights into the genetic history of apple domestication中的Figure3中的d图

如何用R语言ggplot2画折线图并添加误差线  
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 第一步是准备数据
如何用R语言ggplot2画折线图并添加误差线  
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数据保存为csv格式

df<-read.csv("line.csv",header=T)
df
   基本的折线图
library(ggplot2)
head(df)
ggplot(df,aes(x=time_point,y=value))+
  geom_line()+
  geom_point()+
  ylim(0,40)
 
如何用R语言ggplot2画折线图并添加误差线  
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 添加误差线
ggplot(df,aes(x=time_point,y=value))+
  geom_line()+
  geom_point()+
  ylim(0,40)+
  geom_errorbar(aes(ymin=value-sd,
                    ymax=value+sd),
                width=0.2)
 
如何用R语言ggplot2画折线图并添加误差线  
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 这样基本就做好了,接下来就是美化
  • 去掉灰色背景
  • 添加坐标轴线
  • 更改坐标轴的刻度和标签
ggplot(df,aes(x=time_point,y=value))+
  geom_line()+
  geom_point()+
  ylim(0,40)+
  geom_errorbar(aes(ymin=value-sd,
                    ymax=value+sd),
                width=0.2)+
  theme(panel.background = element_blank(),
        axis.line.x = element_line(),
        axis.line.y = element_line())+
  scale_x_continuous(breaks = 1:13,
                     labels = df$label)+
  labs(x=NULL,y=NULL,title = "AAA")
 
如何用R语言ggplot2画折线图并添加误差线  
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 接下来是拼图
p1<-ggplot(df,aes(x=time_point,y=value))+
  geom_line()+
  geom_point()+
  ylim(0,40)+
  geom_errorbar(aes(ymin=value-sd,
                    ymax=value+sd),
                width=0.2)+
  theme(panel.background = element_blank(),
        axis.line.x = element_line(),
        axis.line.y = element_line())+
  scale_x_continuous(breaks = 1:13,
                     labels = df$label)+
  labs(x=NULL,y=NULL,title = "AAA")
library(cowplot)
plot_grid(p1,p1,p1,p1,p1,p1,ncol=2,nrow=3)
 
如何用R语言ggplot2画折线图并添加误差线   

以上就是如何用R语言ggplot2画折线图并添加误差线,小编相信有部分知识点可能是我们日常工作会见到或用到的。希望你能通过这篇文章学到更多知识。更多详情敬请关注创新互联行业资讯频道。


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