HLAEpitopeRegistry-HLA抗原表位数据库有什么用
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抗原表位指的是抗原分子中决定抗原特异性的特殊化学基因,抗原通过抗原表位与对应的抗原受体想结合,从而引起免疫应答反应。一个抗原分子可以含有多个抗原表位,抗原表位的性质,数目和空间结构决定了抗原的特异性。
多种抗原分子之间会存在共有的抗原表位,由这些共同的抗原表位刺激机体而产生的抗体可以与多种抗原分子相结合,这种想象叫做交叉反应。
采用常规的血清学手段对HLA分型时,由于交叉反应的存在,并不能特异性的鉴定某一种抗原,所以血清学分型的结果,对应的是多个抗原的集合。为了了解HLA抗原的特异性,就必须对其抗原表位进行研究。HLA Epitope Registry 是一个在线的数据库,存储了HLA Allel 对应的抗原表位信息。
网址如下:
http://epregistry.ufpi.br/
对于不同的HLA 基因座,采用了不同的子数据库进行存储,共有以下几个子数据库
ABC
DRB
DQB+DQA
DPB + DPA
MICA
以ABC
为例,该数据库存储的是HLA-A , HLA-B, HLA-C 这3个经典的HLA I 型基因的抗原表位信息,网址如下
http://epregistry.ufpi.br/index/databases/database/ABC/
第一列是抗原表位的名字,第二列代表该基团是否暴露在抗原分子表面,第三列信息和第一列一样, 第四列表示频率, 可以连接到ANFD数据库, 第五列表示抗体反应,如果存在实验证据支持,取值为confirmed
,其他则为provisional
; 第六列表示抗原表位的结构,第七列表示Luminex 芯片中对应的HLA Allel; 第八列表示抗原表位对应的所有的Allel。
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新闻标题:HLAEpitopeRegistry-HLA抗原表位数据库有什么用
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